type variants nf:使用ncov2019 artic nf管道的输出来检测SARS CoV 2变体 源码

类型变量nf 概括 该管道用于运行connor-lab / ncov2019-artic-nf的“ typing”部分,以检测SARS-CoV-2“相关变量”。 用法 nextflow run main.nf \ --variants_dir \ --ref \ --gff \ --yaml \ --outdir \ --prefix 示例输出 输出目录结构: .typing_summary.csv .variant