Epichloe_WGS_temp 源码

Epichloe WGS脚本和补充文件 这是一个与提交的MS相关联的脚本和文件的存储库,其中描述了鼠伤寒埃希氏菌和Epichloe clarkii的全基因组序列的装配和注释。 注释文件的自述文件 对于所有这些注释文件名-“ Ec”表示Epichloe clarkii,“ Et”表示Epichloe typhina 来自Interproscan Ec_mb_itps.tsv Et_mb_itps.tsv的原始数据(tsv) 使用R我们创建了一个新文件用于下游分析。 我们仅保留了以下数据库中的信息:“ CDD”,“ Gene3D”,“ PANTHER”,“ Pfam”,“ SUPERFAMI