Unified_genealogy_paper:现代与古代人类的统一家谱 源码

代码“现代和古代基因组的统一家谱” 此回购包含“现代和古代基因组的统一家谱”中使用的代码。 这包括: 基于模拟的和验证 管道以从多个数据集中生成统一的日期树序列 使用古代基因组对树序进行实证验证 代码以产生论文中的所有非示意图人物,以及交互式人物和补充视频 这些分析如下放置在子目录中: all-data包含用于下载和准备实际数据的所有代码,以及用于创建树序列的​​管道 src包含用于对真实和模拟数据进行分析和验证的脚本 data包含某些分析所需的参考数据,并且是在其中存储对真实推断的树序列执行的分析结果的位置。 在这里也可以进行评估tsinfer中失配参数的仿真。 simulated-