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VSEARCH 介绍 该项目的目的是创建由Robert C. Edgar(2010)开发的工具的替代方案。 新工具应: 具有适当的开源许可证的开源代码 免费,免费 采用64位设计,可处理非常大的数据库和超过4GB的内存 与usearch一样准确或更准确 比usearch快或快 我们已经实现了一个称为VSEARCH的工具,该工具支持基于从头和参考的嵌合体检测,聚类,全长和前缀去重复,重复复制,反向互补,掩盖,全对全配对全局比对,精确和全局比对搜索,混排,二次抽样和排序。 它还支持FASTQ文件分析,过滤,转换和合并成对的末端读取。 VSEARCH代表矢量化搜索,因为该工具利用SIMD矢量化形