拓扑根 源码

TopoRoot:从3D影像进行植物结构分析的自动管道 介绍 TopoRoot是一系列几何算法,可自动从土壤上方和下方的植物结构的3D灰度图像中获取建筑特征,并具有高精度和高产量。 我们的管道可能会应用于批处理大量3D图像,可能出于遗传表型研究的目的,也可能会应用于单个图像。 第一次,我们从计算机图形学中引入了最先进的技术来解决一些拓扑和几何问题,这些问题在用于植物表型的图像分析管道中经常遇到。 这些贡献包括: 从成像重建的形状中去除多余的拓扑特征。 这些拓扑特征包括合并的分支,不连续的组件,噪声和内部空隙,这些空隙由我们的管道使用[Zeng et al。 等,2020]。 用弯曲的骨架(