波罗的海:波罗的海 适应性强的轻型树导入代码用于分子系统发育操纵分析和可视化。 该派生叉将不再接收更新因此对波罗的海的任何进一步开发都将在https:githu

波罗的海:以反义词命名的自适应轻量级树导入代码 最初开发波罗的海以自定义方式从衍生的分子系统发育中提取各种统计数据。 我的使用波罗的海代码的早期版本来研究根据基因组背景如何构建人类乙型流感病毒片段多样性。 从那以后,我将代码的各个部分分为三部分: 波罗的海 是树解析器本身。 它使用三个主要类-节点,叶和树来导入,操纵和绘制具有多种注释的BEAST树。 节点和叶类引用了系统发育中常见的参数集-指定分支的字符串索引(树中的唯一标识符),长度,高度,时间位置(absoluteTime),X和Y坐标,对BEAST分支注释(特征)进行编码的字典,对它们的父项的引用(对于根目录无提示)以及指定其类型的字符