bioinfo_benchmarks:对生物信息学脚本编写很重要的语言基准 源码

一些可疑和务实的基准 此存储库包含用于评估要用于字符串密集型程序(生物信息学)的语言的代码。 基准测试并未试图找到解决文件中字段数量计数问题的最快方法,它们只是用来演示以下内容: 可脚本编写性-从stdin和分割行读取文本有多容易? IO-语言处理IO的方式在本质上有些慢吗? 字符串操作-用于执行字符串操作的内建函数是否高效,或者它们看起来很漂亮? 轻量级类-我们可以便宜地创建一个类来保存数据吗? 数组和字符串分配-编译器/解释器是否优化分配? (尚未完成)C绑定-使用ac库有多容易? (尚未完成)C互操作-与C库进行交互是否需要大量费用? 伪代码 输入是制表符分隔的文件。 P