Spark技术在基因序列分析中的应用

生命科学方兴未艾,从食品工业中的细菌培养鉴定到癌症快速诊断,基于DNA分析的应用不断出现,但同时基因分析应用也面临着很大挑战;许多新技术、新方法被应用到基因序列分析应用中,包括 Spark、FPGA以及GPU协处理器加速等,这些技术的应用不仅能够使大部分生命科学领域的应用,包括开源和 ISV软件,在不需要复杂的MPI编程情况下实现并行化处理,同时Spark内存内计算技术也能够提高分析效率,加速工作流程,