cytoscape—插件clueGO的使用

这里我简单介绍一下clueGO的使用 首先需要下载clueGO的插件 app—App Manager—clueGO安装 需要进行注册,才可以使用,这也是为什么我不太喜欢用这个插件的原因之一 下面就是使用clueGO,先apps—-clueGO,打开这个插件 选择合适的物种,这里我用的是人的,粘贴Gene symbol 分别勾选CC、MF。BP是默认选中的 在富集过程中,会通过超几何的方法计算p值,这里可以选择p小于0.05的,将这部分结果展示 然后点击start 之后出现这样的界面,等待就可以了 该结果展示的是富集结果的网络图。每个节点是代表性富集通路,节点的连线表示通路之间的