离散微分几何和蛋白质复合物的结构研究

本文提出了一种新颖的三维方法进行蛋白质复合物的结构研究。 在该方法中,将使用一对二维三角锥(具有多个顶部顶点)的交点来描述蛋白质分子的表面。 作为蛋白质复合物的数学玩具模型,我们考虑n个单纯形(n = 2,3,4 ...)的闭合轨迹的复合物,其中蛋白质复合物的设计问题对应于汉密尔顿循环问题的扩展版本。 问题是找到n个单纯形的“一组”闭合轨迹,该轨迹填充由给定的一对n + 1维三角锥定义的n维区域。 在这里,我们使用三角形的离散微分几何(即2个单纯形)在n = 2的情况下给出扩展哈密顿循环问题的解决方案。