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代谢网络的模块化分析有助于理解网络的结构和功能。然而,当前众多的模块化分析方法大多将代谢网络考虑为普通的复杂网络,所得模块的生物学意义较低。对枯草芽孢杆菌的核黄素代谢进行Petri网建模分析,研究结果表明:Petri网的T不变量可用于识别代谢网络中的功能模块,具备较好的生物学意义。