全基因组SNP的鉴定和高粱应激反应相关蛋白的测定(

高粱育种计划的当前努力是利用测序基因分型(GBS)数据来提供所需特征的全基因组扫描。 这项研究的目的是利用GBS方法鉴定与高粱(Sorghum bicolor L. Monech)品种的胁迫响应相关的基因组区域。 对干旱具有不同反应的二十个高粱种的DNA样品用于制备GBS文库进行测序。 使用TASSELGBS管道调用SNP,并考虑在数据集中出现至少10次的标签并将其与高粱双色参考基因组对齐。 将鉴定出的单核苷酸多态性(SNP)与已发表的与应激反应基因活性有关的高粱转录本进行比较。 总体; 对齐了94.40%的标签,并确定了69,736个推定的SNP位置。 爆炸搜索显示与注释的耐热和耐旱相关基因