论文研究 微细加工装置中DNA分离的计算研究:通用方法和最新应用的回顾。

DNA分离技术因其在基因分析和操纵等应用中的用途而备受关注。 与使用凝胶电泳的传统方法相比，利用微细加工设备进行更快，更有效的分离已有许多研究。 尽管许多实验研究已经提出了各种新的设备和方法，但是计算研究通过确定分离机制并找到有效分离条件的最佳设计，在这一发展中发挥了关键作用。 在微型设备中模拟DNA分离方法需要正确捕获动力学和单个聚合物分子的结构，该动力学和结构受复杂几何形状中施加的流场或电场的影响。 在这项工作中，我们总结了聚合物模型（珠-弹簧模型，珠-棒模型，细长体模型和接触珠模型）和方法，重点是用于计算非均匀场的布朗动力学模拟。考虑到复杂的边界（有限元方法，边界元方法，晶格-玻尔兹曼方