论文研究 SAHA抑制锌的生物物理机制

在产酸博德特氏菌中鉴定出的含锌酶HDAC样酰胺水解酶（FB188 HDAH）与参与表观遗传机制（例如组蛋白修饰）的酶相似。 FB188 HDAH与拮抗剂SAHA（suberoylanilide异羟肟酸）复合的X射线晶体结构已得到解决（PDB ID：1ZZ1）。 值得注意的是，络合物在晶体的不对称晶胞中结晶为四聚体。 该晶体产生合适的结构以分析SAHA对该组蛋白脱乙酰基酶的抑制机理的动力学。 应用计算化学技术和量子力学理论，计算了几种物理化学性质，以比较四种单体的酶的活性位点。 在结合袋的面积和体积以及疏水相互作用，偶极矩，原子电荷和静电势等方面观察到了显着差异。 值得注意的是，通过评估SAHA