论文研究 用δ溶血素及其在HP模型中的变体阐述二维格子中最简单的折叠结构

尽管先进的3维结构测量在蛋白质数据库中提供了越来越详细的结构，但最简单的2维晶格模型仍然有意义，因为2维结构相对于3维结构起着补充作用。 在这项研究中，在二维晶格上研究了δ-溶血素及其六个变体的折叠结构，并借助归一化氨基酸疏水性指数根据HP模型考虑了它们在折叠结构中的氨基酸接触。 结果表明：1）由于对称性，δ-溶血素或其每个变体都可以在1,129,718,145,924个折叠结构的八分之一中找到其任何折叠结构，这减少了折叠所需的时间，2）pH对折叠的影响结构是变化的，并且直接与氨基酸序列本身相关； 3）变体的折叠结构的变化因情况而异，并且4）为每个氨基酸分配疏水性指数是区分相同折叠结构的一种方