论文研究 观测数据驱动的早期仿真分析框架

尖端实时显微镜和图像分析的最新发展为系统研究单个细胞的动力学以及基于模拟的假设检验提供了独特的机会。 在总结了与秀丽隐杆线虫胚胎发生相关的观察和建模工作中的数据生成和分析后，我们开发了一种系统的方法来对单个细胞的基本行为进行建模。 接下来，我们介绍在基于代理的建模框架中使用3D延时图像对细胞命运，分裂和运动进行建模的想法。 然后，我们总结了初步结果并讨论了细胞命运，分裂和运动建模方面的工作。 最后，我们讨论了秀丽隐杆线虫胚胎建模的正在进行的工作和未来的方向，包括推断出的细胞命运发展态势，拟定细胞分裂的准平衡模型以及用于细胞运动的多智能体，深度强化学习。