论文研究改进CKSAAP结合RFE算法预测蛋白质棕榈酰化位点.pdf

蛋白质棕榈酰化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰，在蛋白质稳定性和亚细胞定位等方面发挥重要作用。构建了一种预测蛋白质棕榈酰化位点的新模型（PSSM-CKSAAP-RFE）。采用蕴含进化信息的[k]-spaced氨基酸对组分方法表征蛋白质序列，通过递归特征消除法进行特征选择；基于上述特征训练支持向量机分类器，并采用夹克刀交叉验证法测试模型性能。研究结果显示，训练集和独立测试集的预测准确率、马修斯相关系数、特异性、敏感性和受试者工作特征曲线下面积分别为98.44%、0.94、98.95%、95.65%和0.990，以及98.41%、0.93、99.39%、92.31%和0.994，优于文献中报道的相关方