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论文研究 基于8维矢量表示的DNA序列分析的一种新数值方法。

上传者: 2020-06-18 18:35:54上传 PDF文件 762.26KB 热度 15次
背景:多序列比对(MSA)算法是比较和分析DNA序列的传统方法。但是,对于大的DNA序列,这些算法需要较长的计算时间。目的:在这里我们将提出一种新的数值方法来快速表征和比较DNA序列。方法:基于新的二维(2D)DNA序列图形表示,我们可以使用概率的两个基本概念(均值和方差)获得8维向量。结果:我们在两个真实的DNA数据集,分别是11种β-珠蛋白基因的第一个外显子和31个哺乳动物线粒体基因组的编码序列之间进行了相似性/相异性分析。结论:我们的结果与我们文献中的现有分析相符。我们还将我们的方法与其他方法进行比较,发现我们的方法更有效。
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