GSEA_Win_4.0.2installer.exe

GSEA富集分析，1、准备三个文件第一行：#1.2，表示版本号，自己准备文件时照抄就行； 第二行：两个数分别表示geneNAME的数量和样本数量（矩阵列数-2）； 矩阵：第一列是NAME；第二列Description，没有的话可以全用na或任意字符串填充；后面的就是基因在不同样本中标准化后的表达数据了（部分统计量metricsforrankinggenes计算需要log转换后的数据，后面会有提及。其它情况是否为log转换的数据都可用，GSEA关注的是差异，只要可比即可）。 #其次是样品分组信息（通常用.gmt作为后缀） 第一行：三个数分别表示：34个样品，2个分组，最后一个数字1是固